1952年2月，与浙江大学医学院合并，更名为浙江医学院。
1958年8月，浙江医学院从杭州分迁部分员工、设备和图书来到温州，成立“浙江第二医学院”。10月，以校址所在地改名为温州医学院，开始招收五年制本科学生。
1978年，学校开始招收硕士研究生。
2001年，浙江省温州卫生学校并入。
2007年，被教育部批准为首批招收本科临床医学专业（英语授课）来华留学生的高等学校。
2011年，获批接受中国政府奖学金来华留学生。
2012年11月，温医获批成为第一批卓越医生教育培养计划项目试点高校，承担“五年制临床医学人才培养模式改革试点”和“农村订单定向免费医学教育人才培养模式改革试点”两项改革试点项目。
2013年4月18日，教育部复函浙江省人民政府，同意温州医学院更名为温州医科大学。